Después del segundo impacto, todo lo que queda de Japón es Tokio-3, una ciudad que está siendo atacada por criaturas gigantes que buscan erradicar a los humanos, llamados Ángeles. Después de no ver a su padre por más de ocho años, Shinji Ikari recibe una llamada telefónica en la que le dicen que venga urgentemente a la sede de NERV, una organización que se ocupa de la destrucción de los Ángeles mediante el uso de mechs gigantes llamados Evas. El objetivo de Shinji es pilotar la Unidad Eva 01 mientras trabajas en equipo con el piloto de la Unidad Eva 00, Ayanami Rei. El argumento está basado en los episodios del 1 al 6 de la serie original. Aunque algunas situaciones se muestran de diferente forma, tales como ángulos de camara, historias alternativas,ect. 1.01: 266 mejoras adicionales de 1.0. 1.11: 2 minutos más que 1.0 y 1.01 y creado al procesar los datos digitales maestros en lugar de la película de 35 mm.
Después del segundo impacto, todo lo que queda de Japón es Tokio-3, una ciudad que está siendo atacada por criaturas gigantes que buscan erradicar a los humanos, llamados Ángeles. Después de no ver a su padre por más de ocho años, Shinji Ikari recibe una llamada telefónica en la que le dicen que venga urgentemente a la sede de NERV, una organización que se ocupa de la destrucción de los Ángeles mediante el uso de mechs gigantes llamados Evas. El objetivo de Shinji es pilotar la Unidad Eva 01 mientras trabajas en equipo con el piloto de la Unidad Eva 00, Ayanami Rei. El argumento está basado en los episodios del 1 al 6 de la serie original. Aunque algunas situaciones se muestran de diferente forma, tales como ángulos de camara, historias alternativas,ect. 1.01: 266 mejoras adicionales de 1.0. 1.11: 2 minutos más que 1.0 y 1.01 y creado al procesar los datos digitales maestros en lugar de la película de 35 mm.