Catorce años después del Tercer Impacto, la Tierra es un páramo post-apocalíptico, la civilización humana está en ruinas y la gente que Shinji conoce es casi irreconocible. Atrapado dentro de Evangelion Unit-01, Asuka y Mari lo recuperan del espacio, solo para encontrarse prisionero de Wille, una facción militar dirigida por su ex tutor, Misato Katsuragi. Frío y amargo, sus antiguos aliados lo ven con sospecha y se niegan a apoyarlo cuando llega a un acuerdo con las consecuencias de sus acciones. Un Shinji herido y confundido es rescatado de Wille por Rei y regresó a la sede de Nerv. Allí, conoce y se hace amigo rápidamente del enigmático Kaworu Nagisa, quien le ofrece calidez y comprensión del estado de la guerra de Nerv con los Ángeles. Pero el breve respiro de Shinji y Kaworu se encuentra en la víspera de una nueva batalla, en la que Shinji descubre que sus enemigos ya no son ángeles sino ex compañeros. En esta amarga confrontación para determinar el futuro del mundo, Shinji aprenderá de primera mano que el pasado realmente no se puede deshacer.
Catorce años después del Tercer Impacto, la Tierra es un páramo post-apocalíptico, la civilización humana está en ruinas y la gente que Shinji conoce es casi irreconocible. Atrapado dentro de Evangelion Unit-01, Asuka y Mari lo recuperan del espacio, solo para encontrarse prisionero de Wille, una facción militar dirigida por su ex tutor, Misato Katsuragi. Frío y amargo, sus antiguos aliados lo ven con sospecha y se niegan a apoyarlo cuando llega a un acuerdo con las consecuencias de sus acciones. Un Shinji herido y confundido es rescatado de Wille por Rei y regresó a la sede de Nerv. Allí, conoce y se hace amigo rápidamente del enigmático Kaworu Nagisa, quien le ofrece calidez y comprensión del estado de la guerra de Nerv con los Ángeles. Pero el breve respiro de Shinji y Kaworu se encuentra en la víspera de una nueva batalla, en la que Shinji descubre que sus enemigos ya no son ángeles sino ex compañeros. En esta amarga confrontación para determinar el futuro del mundo, Shinji aprenderá de primera mano que el pasado realmente no se puede deshacer.