El personaje principal, Tohno Shiki, sufrió un accidente durante su infancia. Quedó tan malherido que se le daba ya por muerto, pero milagrosamente sobrevivió. Sin embargo, debido a este accidente, Shiki es enviado lejos de la casa Tohno, su hogar, y es asignado a los cuidados de unos parientes lejanos de la familia. Pero Shiki guarda un secreto. Desde el accidente, tiene la capacidad de ver unas líneas en las cosas por las que estas pueden romperse fácilmente. Si una hoja pasase por esas líneas, cualquier cosa podría ser cortada con facilidad. Preocupado por esta capacidad, el joven Shiki recibe unas gafas de una mujer que encuentra (a la que Shiki llama "Profesora"), que impide que pueda ver esas "líneas de la muerte". Gracias a eso, Shiki puede llevar una vida normal. Hast que que recibe una carta. El cabeza de familia de la casa Tohno, su padre, ha muerto. Por orden del nuevo cabeza de familia, debe volver inmediatamente a la casa Tohno. Es entonces cuando Shiki, ahora un estudiante de instituto, vuelve a la casa Tohno y comienza la historia.
El personaje principal, Tohno Shiki, sufrió un accidente durante su infancia. Quedó tan malherido que se le daba ya por muerto, pero milagrosamente sobrevivió. Sin embargo, debido a este accidente, Shiki es enviado lejos de la casa Tohno, su hogar, y es asignado a los cuidados de unos parientes lejanos de la familia. Pero Shiki guarda un secreto. Desde el accidente, tiene la capacidad de ver unas líneas en las cosas por las que estas pueden romperse fácilmente. Si una hoja pasase por esas líneas, cualquier cosa podría ser cortada con facilidad. Preocupado por esta capacidad, el joven Shiki recibe unas gafas de una mujer que encuentra (a la que Shiki llama "Profesora"), que impide que pueda ver esas "líneas de la muerte". Gracias a eso, Shiki puede llevar una vida normal. Hast que que recibe una carta. El cabeza de familia de la casa Tohno, su padre, ha muerto. Por orden del nuevo cabeza de familia, debe volver inmediatamente a la casa Tohno. Es entonces cuando Shiki, ahora un estudiante de instituto, vuelve a la casa Tohno y comienza la historia.