Al igual que su precuela, Zoku Natsume Yuujinchou trata sobre Takashi Natsume, un niño que ha tenido la capacidad de ver a youkai desde que era joven, y su guardaespaldas youkai Madara, apodado Nyanko-sensei. Natsume intenta devolver los nombres escritos en su "Libro de los Amigos" (que heredó de su abuela Reiko) a youkai en su aldea. A lo largo de estas aventuras, se encuentra con algunos youkai que son amistosos, algunos que quieren robar el Libro y otros que quieren matarlo, mientras Natsume aprende sobre él y su relación con estos seres misteriosos en el camino.
Al igual que su precuela, Zoku Natsume Yuujinchou trata sobre Takashi Natsume, un niño que ha tenido la capacidad de ver a youkai desde que era joven, y su guardaespaldas youkai Madara, apodado Nyanko-sensei. Natsume intenta devolver los nombres escritos en su "Libro de los Amigos" (que heredó de su abuela Reiko) a youkai en su aldea. A lo largo de estas aventuras, se encuentra con algunos youkai que son amistosos, algunos que quieren robar el Libro y otros que quieren matarlo, mientras Natsume aprende sobre él y su relación con estos seres misteriosos en el camino.